Il pesce nella dieta chetogenica apporta 0 a 1 g di carboidrati per 100 g, 20 a 25 g di proteine complete e, nelle specie grasse come il salmone, 12 a 15 g di grassi ricchi di acidi omega-3. Le specie ottimali per la keto sono salmone (13 g grassi, 0 g carb), sgombro (14 g grassi), sardine (10 g grassi) e merluzzo (1 g grassi, 18 g proteine). La frequenza raccomandata è di 2 a 4 porzioni da 150 a 200 g a settimana. Le preparazioni compatibili con la chetosi escludono panature, salse zuccherate e marinature con amidi.
Le linee guida EFSA raccomandano da 250 a 500 mg di EPA e DHA al giorno, raggiungibili con 2 porzioni settimanali di pesce grasso. Il pesce in scatola al naturale (sgombro, sardine, tonno) conserva il profilo lipidico utile e rappresenta un'alternativa economica al pesce fresco per chi segue la dieta chetogenica.